Роман "Чорнильне серце" демонструє читачам два світи: реальний світ любителів книжок з їхніми багатими бібліотеками та рідкісними виданнями (одна з яких дала назву твору) та уявний, вигаданий світ книжок, населений фантастичними істотами, ельфами, феями, але також і тиранами, темними силами, котрі намагаються заполонити Землю страхом. Прямий зміст назви роману полягає в тому, що "Чорнильне серце" – це книжка, навколо якої розгортаються події твору. І Мо, і Вогнерукий, і Каприкорн мріють мати цю книжку, і в кожного є свої причини володіти нею. Переносний зміст назви роману допоможуть зрозуміти цитати з твору: "Вона (Мортола) була в захваті від його жорстокості, їй подобалося бачити, як він нагонить на людей страх. Вона любила його серце – чорне, як чорнило", "Каприкорн упав ницьма, а його чорне серце спинилося". "Чорнильне" серце – це серце Каприкорна, який уособлює величезне зло і приносить страждання головним героям.